על תוכנית מכתבת אלפאנוס מתבצעת הערכה מחקרית באופן שוטף ע"י משרד החינוך (ראמ"ה – הרשות הארצית למדידה והערכה בחינוך) ועל ידי הקרנות שתומכות בתוכנית – קרן גרינספון וקרן פרייס. 

להלן ממצאי ההערכה בשנים האחרונות:

• ממצאי הערכה של ראמ”ה לשנה”ל תשע”ו (2015-2016) – דיווח מילולי מלא /מצגת ממצאים עיקריים
• דיווח הערכה ינואר – יוני 2014-2015 (מקוצר)
• דיווח הערכה אמצע שנת 2014-2015 (מקוצר)
• דיווח הערכה ינואר-יוני  2014 (מקוצר)
• דיווח הערכה לתכנית “מכתבת אלפאנוס-ספריית העששית” ינואר -יוני 2014 (מלא)